Protein Dynamics Prediction (Dyna-1)

简介

Dyna-1 是一种蛋白质动力学预测模型，可基于蛋白质结构预测每个氨基酸残基发生微秒至毫秒（μs–ms）时间尺度构象运动的概率，从而识别具有潜在构象交换和动态变化的区域，辅助分析蛋白质功能、配体结合及酶催化相关的动态特征。

参数说明

PDB File

输入预测蛋白质结构，支持PDB/CIF。

Chain

指定需要预测的链ID。

结果说明

输出dyna_prediction.pdb，其中B-factor 将被替换成预测概率

输出dyna_prediction.csv，说明如下：

参考文献

Wayment-Steele, Hannah K.; El Nesr, Gina; Hettiarachchi, Ramith; Ojoawo, Adedolapo; Kariyawasam, Hasindu; Ovchinnikov, Sergey; Kern, Dorothee. Learning millisecond protein dynamics from what is missing in NMR spectra. Nature, 2026. DOI: 10.1038/s41586-026-10989-4