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介绍文档
| 编号 | 599 | |
| 名称 | Multispecific Ab Structure Prediction (AbForge) | |
| 封面 |  | |
| 描述 | 从完整链 FASTA 建模双抗、三抗及多特异抗体结构。 | |
| 标签 |
| |
| 作者 | WECOMPUT | |
| 发布时间 | 2026-09-19 16:20:00 | |
| 参考文献 | ||
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- 简介
- 参数说明
- Sequence
- Output
- 结果说明
Multispecific Ab Structure Prediction (AbForge)
简介
多特异抗体结构预测。通过结构域注释、拓扑分型预测，将完整抗体结构分割为多段高置信度结构区域，分别建模后组合为完整结构。支持主流双抗/三抗分型，或其他自定义拓扑分型。
常见多特异性抗体分型：
对称 IgG-scFv、KiH 异源 IgG、CrossMab、DVD-Ig / CODV、Fab / scFv-Fc 混臂、scFv-Fc、BiTE、TandAb、串联 Fab 等等。
案例｜amivantamab（埃万妥单抗，Rybrevant）
Janssen 的 DuoBody 分子：两条不同重链 + 两条不同轻链，一侧结合 EGFR，一侧结合 MET。重链异源二聚靠 DuoBody 的 CH3 突变（F405L / K409R），不是经典 Knob-into-Hole。适应症为携带 EGFR 20 号外显子插入的非小细胞肺癌。这是最接近常规 IgG 的异源双抗——Y 型核心必须站得住，两臂 Fab 分开。
AbForge 给出标准 Y 型，两臂 Fab 分开、Fc 成对；Protenix 2.0 把两臂折向 Fc；openDDE 失去 Y 型，模块挤成一团。
参数说明
Sequence
多特异性抗体的完整序列文件，FASTA格式。如IgG+scfv双抗的序列如下：
>SUBUNIT_1
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSSYDMSWVRQAPGKGLDWVATISGGGRYTYYPDSVKGRFTISRDNSKNNLYLQMNSLRAEDTALYYCANRYGEAWFAYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGKGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSQVQLVESGAEVKKPGASVKVSCKASGYSFTGYTMNWVRQAPGQCLEWIGLINPYNNITNYAQKFQGRVTFTVDTSISTAYMELSRLRSDDTGVYFCARLDYRSYWGQGTLVTVSAGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSQAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCGSSTGAVTTSNFPNWVQQKPGQAPRSLIGGTNNKASWTPARFSGSLLGGKAALTISGAQPEDEAEYYCALWYSNHWVFGCGTKLTVLR
>SUBUNIT_2
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>SUBUNIT_3
DIQMTQSPSSMSASVGDRVTFTCRASQDINTYLSWFQQKPGKSPKTLIYRANRLVSGVPSRFSGSGSGQDYTLTISSLQPEDMATYYCLQYDEFPLTFGAGTKLELKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
>SUBUNIT_4
DIQMTQSPSSMSASVGDRVTFTCRASQDINTYLSWFQQKPGKSPKTLIYRANRLVSGVPSRFSGSGSGQDYTLTISSLQPEDMATYYCLQYDEFPLTFGAGTKLELKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
Output
装配后的结构 PDB 文件名。
结果说明
| 输出文件名称 | 说明 |
|---|---|
| final_pred_model.pdb | 装配后的多特异抗体结构 |
