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模块信息
介绍文档
| 编号 | 597 | |
| 名称 | Humanization Report v2.7 | |
| 封面 |  | |
| 描述 | 抗体人源化设计报告生成模块，用于生成最终的抗体人源化设计报告以及相应的专利实施例段落。 | |
| 标签 |
| |
| 作者 | WECOMPUT | |
| 发布时间 | 2024-12-23 00:00:00 | |
| 参考文献 | ||
目录导航
- 简介
- 参数说明
- 方法1：Humanization Report
- Graft Policy
- Mutate Policy
- Antibody Type
- Germline Score File
- Mutation Score File
- Antibody RMSD File
- Antibody RMSD Top
- Folding Stability File
- Structure Prediction Score File
- 方法2：Humanization HTS Report
- Graft Policy
- Mutate Policy
- Antibody Type
- Germline Score File
- Mutation Score File
- Antibody RMSD File
- Antibody RMSD Top
- Folding Stability File
- Structure Prediction Score File
- 结果说明
Humanization Report
简介
Humanization Report 是抗体人源化设计报告生成模块，用于生成最终的抗体人源化设计报告以及相应的专利实施例段落。
更新日志：
- 同时支持人源化和高通量人源化流程
参数说明
方法1：Humanization Report
Graft Policy
Grafting模块生成的Graft Policy文件。
Mutate Policy
Back Mutation Grouping模块生成的Policy文件。
Antibody Type
抗体类型，Antibody 标准双链抗体，Nanobody 纳米抗体。
Germline Score File
Grafting模块生成的score文件，JSON格式
Mutation Score File
Mutation模块生成的score文件，CSV格式
Antibody RMSD File
抗体结构RMSD文件，由Antibody RMSD模块生成，CSV格式
Antibody RMSD Top
从RMSD排序中取前N个RMSD值小的抗体
Folding Stability File
Absolute Folding Stability模块预测生成的蛋白稳定性文件，CSV格式
Structure Prediction Score File
Batch Protein Structure Prediction模块预测结构的打分
方法2：Humanization HTS Report
Graft Policy
Grafting模块生成的Graft Policy文件。
Mutate Policy
Back Mutation Grouping模块生成的Policy文件。
Antibody Type
抗体类型，Antibody 标准双链抗体，Nanobody 纳米抗体。
Germline Score File
Grafting模块生成的score文件，JSON格式
Mutation Score File
Mutation模块生成的score文件，CSV格式
Antibody RMSD File
抗体结构RMSD文件，由Antibody RMSD模块生成，CSV格式
Antibody RMSD Top
从RMSD排序中取前N个RMSD值小的抗体
Folding Stability File
Absolute Folding Stability模块预测生成的蛋白稳定性文件，CSV格式
Structure Prediction Score File
Batch Protein Structure Prediction模块预测结构的打分
结果说明
输出结果包括：
| 输出文件名称 | 说明 |
|---|---|
| BM.pptx | 回复突变位点汇总文件 |
| batch_registration_template.xlsx | 批量注册模板文件 |
| hotspot_summary.xlsx | 风险位点总结 |
| patent_example_template.docx | 人源化设计序列在相应的专利实施例段落 |
| patent_example_en_template.docx | 英文版人源化设计序列在相应的专利实施例段落 |
| back_mutation_grouping.md | 回复突变分组信息 |
| candidate_score.xlsx | 人源化抗体序列的结构和能量打分汇总 |
| humanized_variants.fasta | 抗体人源化设计序列文件，FASTA格式 |
| Report.docx | 抗体人源化设计报告，包括整个人源化设计过程涉及的序列、分组等信息 |
其中batch_registration_template.xlsx包含如下信息：
| 字段名称 | 说明 |
|---|---|
| Protein Sequence | 蛋白序列 |
| Molecule Name | 分子名称 |
其中hotspot_summary.xlsx包含如下信息：
| 字段名称 | 说明 |
|---|---|
| ID | 抗体序列名称 |
| Sequence-CDR | CDR序列区域 |
| Deamidation | 脱酰胺位点 |
| Isomerization | 异构化位点 |
| Cleavage | 酶切位点 |
| Hydrolysis | 水解位点 |
| Glycosylation | 糖基化位点 |
| Cys | 半胱氨酸数量 |
| Oxidation | 氧化位点 |
| High risk | 高风险率 |
| High risk sites | 高风险位点 |
