Mutation Score

简介

Mutation Score是抗体人源化设计中核心模块，是一个基于结构的自动化评分模块。该模块基于抗体的结构信息以及CDR嫁接后的序列信息，对移植抗体（graft）后的FR区的每个氨基酸在替换前后的变化程度进行量化评分。评分越高，说明CDR嫁接过程中氨基酸的替换对CDR区的构象可能影响较大，需要进行回复突变。模块输出每个氨基酸的打分值，用于抗体人源化设计流程中后续的分组和人源化抗体序列的生成。

参数说明

Sequence File

抗体Fv区序列文件，FASTA格式。

Model File

抗体结构文件，PDB格式。

Grafted Sequence

抗体CDR区Graft后的序列文件，FASTA格式。

Germline Hits

抗体FR区序列比对结果文件，FASTA格式

Interface Score

界面相互作用计算结果，包含原子/残基级别的接触信息

Hbond Score

氢键计算结果，包含供体-受体对、距离和角度信息

Output Score

指定输出打分文件的名称，CSV格式。

Antibody Type

抗体类型：

• Antibody：常规抗体
• Nanobody：纳米抗体

Numbering Type

抗体编号规则：kabat，imgt，chothia，martin，aho，ccg

结果说明

输出结果文件为score.csv，包含信息如下：