Batch Fasta Generator

简介

对不同文件中的序列进行组装，输出满足Boltz2批量预测模式需要的序列格式。

参数说明

Sequences_A

进行序列组装的A文件，组装时的固定序列，FASTA格式

Sequences_B

进行序列组装的B文件，组装时的遍历序列，FASTA格式

Sequences_C

进行序列组装的C文件，组装时的遍历序列，FASTA格式

Mode

组装模式，选中表示对B，C文件中的序列进行交叉组装。具体组装逻辑见下述。

组装逻辑：
读取A文件中的所有序列，依次读取B文件及C文件中的相同顺序的一条序列进行组装。如果B文件与C文件中的序列数量不一致，或者其中一个文件为空时，则超出部分的序列单独与A文件序列进行组装。示例如下：
A文件中有两条序列A1/2，B文件中有三条序列B1/2/3，C文件中有5条序列C1/2/3/4/5，输出组合后的序列为：

>A1_A2_B1_C1
A1:A2:B1:C1
>A1_A2_B2_C2
A1:A2:B2:C2
>A1_A2_B3_C3
A1:A2:B3:C3
>A1_A2_C4
A1:A2:C4
>A1_A2_C5
A1:A2:C5

如果选择交叉组装模式，则对B，C文件中的序列进行交叉组装，输出组合后的序列为：

>A1_A2_B1_C1
A1:A2:B1:C1
>A1_A2_B1_C2
A1:A2:B1:C2
>A1_A2_B1_C3
A1:A2:B1:C3
>A1_A2_B1_C4
A1:A2:B1:C4
>A1_A2_B1_C5
A1:A2:B1:C5
>A1_A2_B2_C1
A1:A2:B2:C1
>A1_A2_B2_C2
A1:A2:B2:C2
......

结果说明

输出组装后的序列文件combined_seqs.fasta。