Retrosynthetic Prediction (LocalRetro)

简介

LocalRetro 是局部逆合成预测框架，其动机是化学直觉认为分子变化主要发生在化学反应过程中的局部。这与几乎所有现有的逆合成方法不同，这些方法根据分子的全局结构建议反应物，通常包含与反应没有直接关系的精细细节。这个局部概念产生了涉及原子和键编辑的局部反应模板。由于远程官能团也可以作为次要方面影响整个反应路径，因此进一步细化了所提出的局部编码逆合成模型，以通过全局注意力机制来解释化学反应的非局部效应。模型显示，对于包含 50016 个反应的 USPTO-50K 数据集，top-1 名和 top-5 预测的准确率分别为 89.5% 和 99.2%。在包含 479035 个反应（UTPTO-MIT） 的大型数据集上 top-1 和 top-5 准确率分别为 87.0% 和 97.4%。通过从各种文献中正确预测五种候选药物分子的合成途径，还证明了该模型的实际应用。

参数说明

SMILES

输入小分子的SMILES，支持多个批量预测，一行一个，示例：
O=C(Nc4cccc(C(=O)N3CCN(c1ccnc2[nH]ccc12)C3)c4)c5cccc(C(F)(F)F)c5

结果说明

输出的CSV文件包含以下列：

注意: 每个输入分子可能产生多个预测反应，因此一个分子会对应多行数据。

参考文献

• Chen, S.; Jung, Y. Deep Retrosynthetic Reaction Prediction Using Local Reactivity and Global Attention. JACS Au 2021, 1 (10), 1612–1620. DOI: 10.1021/jacsau.1c00246