Small Molecule Generation (EvoMol)
简介
EvoMol 是一款自主研发的智能分子生成平台,面向药物研发与化学合成领域,致力于加速创新化合物的高效发现与优化。EvoMol 支持全局结构优化与指定子结构的局部优化两种模式,能够在更短时间内批量产生多样性更高、结构新颖性更强的候选分子。通过充分利用用户设定的先验信息与设计需求,EvoMol 显著提升分子设计效率,为先导化合物的快速探索和化学空间的高效拓展提供有力支撑。
参数
SMILES
待优化或生成的分子SMILES字符串。可以通过内嵌的wedraw工具生成。

Substructure
需要优化的分子区域/片段SMILES。如果未指定,则对全分子结构优化。可以通过内嵌的wedraw工具生成(方法同SMILES)。
支持的优化模式
EvoMol 支持两种生成/优化策略:
全局结构优化:
仅指定SMILES,对整个分子结构进行创新和优化,输出分子结构多样性更高。
指定区域优化:
同时指定SMILES和Substructure,仅在指定片段区域进行分子修饰,核心结构保持不变,侧链/功能团优化。
Number of Molecules
生成的分子数量,默认为100。
Output SDF
输出文件名,默认为result.sdf
Output SDF
输出文件名,默认为result.csv
结果说明
EvoMol 输出的结果文件(CSV 或 SDF)均包含以下内容:
| 结果名称 |
说明 |
| SMILES/SDF |
分子结构 |
| Similarity |
结构相似度 |
| ID |
分子名称 |
| MW |
分子量,即化合物分子的相对质量 |
| LogP |
脂水分配系数,辅助判断化合物的亲脂性 |
| TPSA |
极性表面积 |