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介绍文档
| 编号 | 450 | |
| 名称 | MolSeeker | |
| 封面 | ![]() | |
| 描述 | 基于大模型多智能体的 ADMET 预测,通过构建分布式智能协作系统,精准预测药物在体内的吸收(Absorption)、分布(Distribution)、代谢(Metabolism)、排泄(Excretion)及毒性(Toxicity)性质。 | |
| 标签 |
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| 作者 | MolSeeker | |
| 发布时间 | 2024-07-30 00:00:00 | |
| 参考文献 | ||
目录导航
- 简介
- 参数说明
- Input File
- Task
- Smiles Columns
- 结果说明
MolSeeker: 大模型多智能体驱动 ADMET 预测
简介
基于大模型多智能体的 ADMET 预测工具,通过构建分布式智能协作系统,精准预测药物在体内的吸收、分布、代谢、排泄及毒性性质。
核心思想
本项目深度融合大语言模型的深度语义理解能力与多智能体系统的分工协作机制:
- 任务拆解:将 ADMET 预测任务拆解为数据清洗、分子表征、性质建模、决策推理等多个子模块
- 智能协作:多个智能体各司其职,协同完成复杂预测任务
- 闭环流程:从分子结构输入到成药性预测的全流程智能化闭环
该流程以“多智能体协同推理”为核心,实现高精度的 ADMET 性质预测。
参数说明
Input File
输入待预测分子的数据文件,支持手动绘制分子结构或上传数据文件,支持 SDF 格式文件或包含 Smiles 列的 CSV 格式文件。
Task
ADMET 性质预测任务选择,支持单选、多选或全选。可选性质类别如下:
- 物理化学性质:LogD、LogP、pKa、pKb、Solubility_Kinetic、Solubility_FASSIF
- 吸收:Caco2_A2B (Cls)、Caco2_A2B (Reg)、PAMPA (Reg)
- 分布:BBB (Cls)、MDCK_Efflux (Reg)
- 代谢:HLM (Cls)、HLM (Reg)、hHep (Cls)、hHep (Reg)
- 毒性:hERG (Cls)、hERG (Reg)、AMES (Cls)、Hepatotoxicity (Cls)
Smiles Columns
存放分子 SMILES 的列名。若使用绘制分子方式输入,无需修改此参数;若上传数据文件,需指定文件中 SMILES 所在的列名。
结果说明
输出结果包括:
| 输出文件名称 | 说明 |
|---|---|
| result.sdf | ADMET 性质预测结果sdf文件 |
| result.csv | ADMET 性质预测结果csv文件 |
包括信息如下:
| 列名 | 说明 |
|---|---|
| MW | 分子量,即化合物分子的相对质量 |
| TPSA | 拓扑极性表面积,反映分子极性大小,影响药物的吸收、分布等性质 |
| PAINS | 是否存在 PAINS 结构警示,PAINS 是可能干扰多种生物测定的化合物 |
| SaScore | 合成可及性得分,评估化合物合成的难易程度 |
| cLogP | 计算的脂水分配系数,体现化合物亲脂性 |
| LogD_pred | 预测的分配系数,用于评估化合物在不同 pH 下的分配特性 |
| LogP_pred | 预测的脂水分配系数,辅助判断化合物的亲脂性 |
| pKa_pred | 预测的酸解离常数,帮助了解化合物的酸性特征 |
| pKb_pred | 预测的碱解离常数,反映化合物的碱性特点 |
| Solubility_Kinetic_Pred | 预测的动力学溶解度,评估化合物溶解过程的动态特性,pH 6.5 |
| Solubility_FASSIF_Pred | 预测的热力学溶解度,模拟胃肠液 FASSIF 介质溶解度,pH 6.5 |
| Caco2_A2B(Cls)_Pred | Caco-2 细胞渗透性分类预测结果,判断药物通过 Caco-2 细胞的渗透能力(分类标准:1×10⁻⁶ cm/s) |
| Caco2_A2B(Reg)_Pred | Caco-2 细胞渗透性回归预测结果,量化药物在 Caco-2 细胞中的渗透程度 |
| HLM(Cls)_Pred | 人肝微粒体稳定性分类预测结果,评估药物在人肝微粒体中的稳定状态类别(分类标准:15 µL/min/mg protein) |
| HLM(Reg)_Pred | 人肝微粒体稳定性回归预测结果,精确衡量药物在人肝微粒体中的稳定性数值 |
| hHep(Reg)_Pred | 人肝细胞相关回归预测结果,对与人肝细胞相关的指标进行量化预测 |
| hHep(Cls)_Pred | 人肝细胞相关分类预测结果,对与人肝细胞相关的性质进行类别判定(分类标准:10 µL/min/1×10⁶ cells) |
| PAMPA(Reg)_Pred | 平行人工膜渗透性测定回归预测结果,评估药物通过人工膜的渗透能力数值 |
| MDCK_Efflux(Reg)_Pred | MDCK 细胞外排回归预测结果,量化 MDCK 细胞对药物的外排程度 |
| BBB(Cls)_Pred | 血脑屏障穿透性分类预测结果,判断药物穿透血脑屏障的能力类别 |
| hERG(Cls)_Pred | hERG 通道抑制分类预测结果,评估药物对 hERG 通道抑制的风险类别(分类标准:10 µM) |
| hERG(Reg)_Pred | hERG 通道抑制回归预测结果,评估药物对 hERG 通道抑制的风险数值 |
| AMES(Cls)_Pred | Ames 试验致突变性分类预测结果,判定药物是否具有致突变性类别 |
| Hepatotoxicity(Cls)_Pred | 肝毒性分类预测结果,评估药物对肝脏产生毒性的风险类别 |



