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介绍文档
| 编号 | 413 | |
| 名称 | Generate Humanized Variants | |
| 封面 | ![]() | |
| 描述 | 抗体人源化设计中基于Grafting以及Back Mutation Grouping的结果批量生成人源化后的序列。 | |
| 标签 |
| |
| 作者 | WECOMPUT | |
| 发布时间 | 2024-12-23 00:00:00 | |
| 参考文献 | ||
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- 简介
- 参数说明
- Graft Policy
- Mutate Policy
- 结果说明
Generate Humanized Variants
简介
抗体人源化设计中基于Grafting以及Back Mutation Grouping的结果批量生成人源化后的序列。
参数说明
Graft Policy
Grafting模块生成的Graft Policy文件,JSON格式
Mutate Policy
Back Mutation Grouping模块生成的组合突变的Policy文件(combination_mutate_policy.json),JSON格式
结果说明
输出人源化后的序列文件humanized_variants_esmfold.fasta,将轻重链的序列通过冒号:拼接成一条链,便于直接用于ESMFold模块进行批量结构预测。示例:
>L1H1
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQFVGSSIHWYQQKPGQAPRLLIYYASESMSGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQSHSWPFTFGQGTKLEIK:EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFIFSNHYMSWVRQAPGKGLEWVSVIRSKSINSATYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARNYYGSTYDYWGQGTTVTVSS
>L1H2
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQFVGSSIHWYQQKPGQAPRLLIYYASESMSGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQSHSWPFTFGQGTKLEIK:EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFIFSNHYMSWVRQAPGKGLEWVSEIRSKSINSATYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARNYYGSTYDYWGQGTTVTVSS



