Antibody Numbering v2

简介

Antibody Numbering v2是抗体编号模块，用于注释抗体可变区（Fv）或恒定区（包括 Fc）， 支持几乎所有主流的抗体编号规则，如可变区广泛使用的Kabat、Chothia 和 IMGT，以及恒定区主要使用的EU规则。

参数说明

Variable Region (Fv)模式

该模式针对抗体的Fv区序列（包括重链 VH 和轻链 VL），通过指定编号规则（如 Kabat、Chothia、或 IMGT）对氨基酸残基进行标准化编号。

Fasta File

抗体序列文件，FASTA格式，支持多序列模式。

Numbering Scheme

可变区编号规则，支持Kabat、Chothia、IMGT，可多选。

Constant Region (Fc)模式

通常用于抗体恒定区的EU、Kabat标准化编号。

Fasta File

抗体序列文件，FASTA格式，支持多序列模式。

Numbering Scheme

恒定区编号规则：eu，kabat。默认为eu。

结果说明

• Variable Region (Fv)模式下的输出结果包括：

三种不同编号规则的csv文件，包含信息如下：

• Constant Region (Fc)模式下EU编号的输出结果包括：

其中output_EU.csv文件，包含信息如下：

注意：在 output_MatchRate.csv 文件中，如果 MatchRate_Global 数值偏低，说明该序列与标准 Fc 区域的相似性较差，可能并不是典型的 Fc 结构，而是linker 或随机插入的非 Fc 序列。

• Constant Region (Fc)模式下Kabat编号的输出结果包括：

其中output_fc_kabat.csv文件，包含信息如下：