Immunogenicity Prediction (WeADApt v4.1)

简介

WeADApt (Wecomput ADA prediction) 是一种基于多模融合架构的免疫原性预测系统。该方法有机地将多个与免疫原性相关的模型融合，构成一个高效的免疫反应模拟系统，可准确地模拟蛋白、抗体、多肽、疫苗等生物药的免疫原性，并能鉴别潜在的免疫原性的T细胞表位（引起临床人体免疫应答的肽段）。
注：该模块非最新版本，通常推荐使用更新版本。

性能测试

使用100多个临床及上市抗体的ADA数据的测试结果显示，预测的打分（MolScore）与ADA发生率的相关性达到R=0.68（下图）。

在同样的42个分子的数据集上，WeADApt预测的相关性超过了知名的商业软件EpiMatrix（R2=0.49 vs R2=0.42)。

打分

0.2分适合作为单抗的高/低风险的阈值（>20% ADA定义为高风险）。

关于双抗/多特异性分子

这类分子仅需输入不重复的链即可
在唯信收集的双抗ADA数据集的测试表现如下图所示。以0.6的分数作为分界线，可以较好的区分高、低风险的双抗分子。双抗
注意，由于存在较多的B细胞清除双抗，其MOA会对ADA产生有较大的影响。

用法

推荐从WeSeq中运行该功能，可以进行更多可视化交互

查看结果

Score为预测的免疫原性风险评分（范围0-1），Risk为风险评级

注意对照结构，排除不可及（包埋的）表位（下图）

去免疫原性

最简单的方式是进行人源片段的替换，可以直接在WeSeq中进行（下图）。

也可以通过频率分析功能引入人源突变。
突变完之后再对突变体预测一下免疫原性是否降低。

注意：从weseq中计算v4免疫原性的结果可以自动保存并且随时再打开的