Gene Enrichment (DAVID)

简介

Gene Enrichment (DAVID)是基于DAVID的基因功能富集分析模块，DAVID是一个生物信息数据库，整合了生物学数据和分析工具，为大规模的基因或蛋白列表提供系统综合的生物功能注释信息。

参数说明

Gene List

基因列表文件，TXT格式，一行一个基因/蛋白。

Gene Identifier

基因名称类型，支持多种数据库基因名称。

P-value

P-value，基因富集中统计差异检验使用的p值的截断值，只保留低于该截断值的富集条目。

Gene Count

基因数目截断值，只保留大于该截断值的富集条目。

Category

基因富集的类别，包括细胞组分（Cellular Component BP），分子功能（Molecular Function MF），生物学过程（Biological Proccess BP）。

Report File

输出基因富集的结果文件，TSV格式。

结果说明

结果输出chartReport.tsv文件，文件中每一列代表说明如下：

参考文献

• B.T. Sherman, M. Hao, J. Qiu, X. Jiao, M.W. Baseler, H.C. Lane, T. Imamichi and W. Chang. DAVID: a web server for functional enrichment analysis and functional annotation of gene lists (2021 update). Nucleic Acids Research. 23 March 2022. 50(W1):W216-W221. doi:10.1093/nar/gkac194.
• • https://david.ncifcrf.gov