Target Prioritization (OpenTargets)
简介
Target Prioritization (OpenTargets) 是提取疾病相关靶点蛋白的模块，基于OpenTarget数据库及其疾病-靶点相关性打分方法。
参数说明
Disease Name
疾病的英文名称，如rheumatoid arthritis
Data Type
数据类型，包括直接关联和全部关联的数据。
direct：直接关联数据，指有直接证据表明该疾病和靶点存在关联。
all：全部关联数据，包括了间接关联数据，间接关联是基于本体论推断出来的疾病靶点关系。
详细可参考：https://platform-docs.opentargets.org/associations
Cutoff
疾病-靶点关系打分的截断值，只输出大于截断值的靶点信息。
Target Class
靶点类型，默认为all 代表全部
结果说明
输出疾病及靶点相关的文件，包括：
| 文件名称 |
文件说明 |
| disease_info.csv |
疾病信息表 |
| target_info.csv |
靶点信息表 |
| targets_by_data_source.csv |
基于数据来源的疾病-靶点关系打分表 |
| targets_by_data_type.csv |
基于数据类型的疾病-靶点关系打分表 |
| uniprot_ids.txt |
靶点的蛋白UniProt ID列表 |
| genes.txt |
靶点的基因名称列表 |
参考文献
https://platform-docs.opentargets.org/
