Antibody RMSD

简介

Antibody RMSD模块对参考抗体结构及其他CDR相同的抗体结构，进行基于Fv区域的结构叠合，并计算CDR区域的RMSD值。支持普通抗体及纳米抗体。
应用场景：人源化后的抗体序列，预测抗体结构后，比较各结构CDR区域的RMSD差异。支持普通抗体及纳米抗体。

参数说明

Antibody Structures

多个抗体结构PDB或CIF文件的压缩打包文件，支持ZIP、TAR.GZ、TAR格式等

Reference Structure

进行RMSD计算的参考抗体结构，PDB格式

Aligned PDB

抗体叠合结构输出名称，TAR.GZ格式

Numbering Type

抗体编号规则：kabat，imgt，chothia，martin，aho，ccg

结果说明

• RMSD计算结果，CSV格式文件result.csv ，包含信息如下：

注意：进行RMSD计算的两个抗体结构，其CDR区域序列应相同，如有差异会导致计算出错。