Nanobody Humanization

简介

纳米抗体（Nanobody, Nbs）是最近出现的一类很有前景的生物医学和治疗应用抗体片段。尽管Nbs具有显著的理化特性，但它来自于驼科动物，可能需要 "人源化"才能提高临床试验的转化潜力。该模块基于Llamanade实现。Llamanade基于NGS（下一代测序）数据库和高分辨率结构，系统分析了Nbs的序列和结构特性。揭示了大量的框架多样性，并强调了Nbs与人类免疫球蛋白G（IgG）抗体之间的关键差异。确定了可能有助于提高溶解度、结构稳定性和抗原结合的保守残基，以促进Nbs的合理人源化。模块以Nbs序列为输入，提供序列特征、模型结构等信息，并优化Nbs人源化的解决方案。对给定的Nbs进行全面人源化分析只需不到一分钟时间。已成功应用于一批结构多样、强效的SARS-CoV-2中和Nbs人源化工作。

参数说明

Nanobody Sequence

纳米抗体的序列，fasta格式，如：

Nb21
MAQVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAVSGLGAHRVGWFRRAPGKEREFVAAIGANGGNTNYLDSVKGRFTISRDNAKNTIYLQMNSLKPQDTAVYYCAARDIETAEYTYWGQGTQVTVS

结果说明

输出humanized_data.csv结果文件，包含以下信息：
Position：残基编号
Original AA：原来残基
Humanized?: 是否需要人源化，True表示需要，False表示不需要
Humanized AA: 人源化后的残基
备注：抗体编号方式采用Martin模式。

参考文献

Llamanade: An open-source computational pipeline for robust nanobody humanization
Sang, Zhe et al. Structure, Volume 30, Issue 3, 418 - 429.e3
https://doi.org/10.1016/j.str.2021.11.006