Sequence Mutation

简介

Sequence Mutation是蛋白序列突变模块，用于针对特定位点批量生成突变序列，支持多样的突变策略，包括设定不同的突变位置及突变类型。

突变策略包括：

• 基于指定位置的突变
• 基于同源序列的突变
• 基于抗体CDR区的突变
• 基于抗体CDR区和同源性的突变

突变类型支持：

• 丙氨酸突变
• 组氨酸突变
• 饱和突变
• 同源突变（同源序列中的进化突变）

参数说明：基于位置的突变

Protein Sequence

蛋白原始序列或者fasta格式的序列

Mutation Location

突变位点，支持多个位点，英文逗号分割，例如：2,3

Mutation Type

突变类型，支持三种类型：Ala 丙氨酸突变，His 组氨酸突变，Sat 饱和突变

Chain Name

链名，输出突变信息时加上指定链名

Mutants Sequences

生成突变序列的文件名称，FASTA格式

Mutation Policy

蛋白突变信息文件，TXT格式

参数说明：基于同源序列的突变

Protein Sequence

蛋白原始序列或者fasta格式的序列

Homologous Sequences

同源序列，一般由序列比对产生的结果文件，FASTA 格式

Alignment Methods

序列比对的方法，mafft或者muscle

Frequency Cutoff

频数截断值，大于截断值的氨基酸才会选择作为突变目标

Chain Name

链名，输出突变信息时加上指定链名

Mutants Sequences

生成突变序列的文件名称，FASTA格式

Mutation Policy

蛋白突变信息文件，TXT格式

参数说明：基于抗体CDR区的突变

Antibody Sequence

蛋白原始序列或者fasta格式的序列

Antibody Numbering

抗体CDR编号规则：kabat, imgt, chothia

Mutation Type

突变类型，支持三种类型：Ala 丙氨酸突变，His 组氨酸突变，Sat 饱和突变

Chain Name

链名，输出突变信息时加上指定链名

Mutants Sequences

生成的包含蛋白突变序列的文件名称，FASTA格式

Mutation Policy

生成的包含蛋白突变信息的文件名称，TXT格式

参数说明：基于抗体CDR区及同源性的突变

Antibody Sequence

蛋白原始序列或者fasta格式的序列

Antibody Numbering

抗体CDR编号规则：kabat, imgt, chothia

Homologous Sequences

同源序列，一般由序列比对产生的结果文件，FASTA 格式

Alignment Methods

序列比对的方法，mafft或者muscle

Frequency Cutoff

频数截断值，大于截断值的氨基酸才会选择作为突变目标

Chain Name

链名，输出突变信息时加上指定链名

Mutants Sequences

生成的包含蛋白突变序列的文件名称，FASTA格式

Mutation Policy

生成的包含蛋白突变信息的文件名称，TXT格式

结果说明