Membrane Solvation

简介

Membrane Solvation对输入的膜，受体，配体文件加入水盒子和离子。

参数说明

Membrane Topology

膜拓扑文件，top格式，可由GMX Membrane Parameterization模块生成。

Membrane GRO

膜结构文件，gro格式，可由GMX Membrane Parameterization模块生成。

Membrane ITP

膜参数压缩文件，tar.gz格式，可由GMX Membrane Parameterization模块生成。

Receptor Topology

受体拓扑文件，top格式，可由GMX Receptor Parameterization模块生成。

Receptor GRO

受体结构文件，gro格式，可由GMX Receptor Parameterization模块生成。

Receptor ITP

受体参数压缩文件，tar.gz格式，可由GMX Receptor Parameterization模块生成。

Ligand GRO

配体结构文件，多配体输入压缩文件，gro格式，可由GMX Ligand Parameterization模块生成。

Ligand ITP

配体参数压缩文件，tar.gz格式，可由GMX Ligand Parameterization模块生成。

Output Topology

体系拓扑文件的输出名称

Output GRO

体系结构文件的输出名称

Output ITP

体系参数压缩文件的输出名称

Output Index

体系索引文件的输出名称

结果说明

输出结果包括：

参考文献