WeMol

编号	276
名称	Molecular Docking (DiffDock)
封面
描述	基于DiffDock的小分子对接工具
标签	Small Molecules Docking DiffDock Small Molecule Enzyme
作者	Gabriele Corso
发布时间	2023-04-21 17:05:53
参考文献	Gabriele Corso, Hannes Stärk, Bowen Jing, Regina Barzilay, Tommi Jaakkola. DiffDock: Diffusion Steps, Twists, and Turns for Molecular Docking. arXivLabs. 2022 Oct (v1).

输出文件名称	说明
Scores.csv	所有配体（≤2000）与受体的打分文件。
output_ligand.sdf	对接后所有配体SDF文件。
output_complex_topn.tar.gz	TopN小分子中每个配体与受体打分最高的复合物构象PDB文件压缩包。
display_complex.pdb	展示配体与受体的复合物构象文件。

字段名称	说明
Ligand ID	配体编号ID
Confidence	对接置信度打分，虽然解读和比较不同复合物或不同蛋白质构象的置信度分数可能会很困难，可以通过以下标准粗略比较（c是最佳构象的置信度分数）：`c > 0`高置信度；`-1.5 < c < 0`中等置信度；`c < -1.5`低置信度
Complex File Name	复合物名称

Molecular Docking (DiffDock)