Synthetic Accessibility Score

简介

Synthetic Accessibility Score是一个化合物合成可行性评估指标，反映了化合物是否容易合成。其将小分子合成难易程度用1到10区间数值进行评价，越靠近1表明越容易合成，越靠近10表明合成越困难。SA Score基于片段贡献和复杂度惩罚从而评估化合物合成的难易程度，其中片段贡献值根据PubChem数据库中上百万分子计算共性进行计算，复杂度则考虑分子中非标准结构特征的占比，例如大环、非标准环的合并、立体异构和分子量大小等方面。SA Score方法已被验证，通过将40个化合物分别采用SA Score和经验丰富的药物化学家评估其合成难易程度，并且比较得到二者评分的相关性R2高达0.89，表明其在识别可合成难易程度上的可靠性较高。SA Score已成为一种普遍使用的指标，可用于预测新化合物的合成可行性，加速化合物筛选和药物发现过程。

参数说明

File模式

Input File

小分子结构文件，支持SDF和SMILES格式。

Smiles模式

Smiles String

小分子结构，SMILES格式，支持多个小分子，一行一个SMILES，例如：
CSC1=C(c2ccc©s2)/C(=N/C©©C)C1
CC1=C(C=C(C=C1)NC(=O)C2=CC=C(C=C2)CN3CCN(CC3)C)NC4=NC=CC(=N4)C5=CN=CC=C5

结果说明

输出结果文件为sa_score.csv，包含信息如下：

参考文献

Ertl P, Schuffenhauer A. Estimation of synthetic accessibility score of drug-like molecules based on molecular complexity and fragment contributions. J Cheminform. 2009 Jun 10;1(1):8.