Metabolism Site Prediction
简介
Metabolism Site Prediction模块为预测小分子被CYP450代谢的代谢位点。模型对小分子的每个原子进行评估被代谢的可能性，并通过打分排序。支持的小分子输入文件格式为：SD（.sdf、.sd）、SMILES（.smi）。
参数说明
Input File
小分子结构文件，SDF或者SMILES格式。
结果说明
输出结果包括：
| 输出文件名称 |
说明 |
| molecule_1_atomNumbers.png |
原子编号图片 |
| molecule_1_heteroAtoms.png |
P450代谢酶（CYP3A4）预测结果图 |
| molecule_1_heteroAtoms1A2.png |
P450代谢酶（CYP1A2）预测结果图 |
| molecule_1_heteroAtoms2C19.png |
P450代谢酶（CYP2C19）预测结果图 |
| molecule_1_heteroAtoms2C9.png |
P450代谢酶（CYP2C9）预测结果图 |
| molecule_1_heteroAtoms2D6.png |
P450代谢酶（CYP2D6）预测结果图 |
| results.csv |
评估被代谢可能性的csv文件 |
| results.html |
评估被代谢可能性的html文件 |
其中results.html，包含如下信息：
| Field Name |
Description |
| Rank |
排序 |
| Atom |
原子类型和序号 |
| Score |
最终的打分，也是排序的标准，打分越低，排名越前，被代谢的可能性越高。 |
| Energy |
能量值，基于DFT计算以及原子匹配得到的原子激活的能量值。是打分Score的重要参考项。 |
| Accessibility |
原子到分子中心的相对拓扑距离。 |
参考文献
Rydberg P, Gloriam DE, Olsen L. The SMARTCyp cytochrome P450 metabolism prediction server. Bioinformatics. 2010 Dec 1;26(23):2988-9.
