PDB Mutation

简介

PDB Mutation是用于突变PDB格式的蛋白质结构并返回突变后的结构。

参数说明

PDB File

蛋白的结构文件，PDB格式

Index Type

为后续突变文件中的残基索引设置类别。有两种选择：UID或者POS
UID表示PDB文件中自带的残基编号，该编号可能存在间断不连续，不从1开始等情况；
POS表示位置编号或自然顺序编号，从1开始按顺序进行编号。默认为POS。

Mutation File

突突变文本文件，包含突变信息，格式如下：

KA100N,KA101T
KA100T
KA100BT

每个突变定义为：
第一字母代表的是原始残基，第二个字母代表PDB文件中待突变残基所在的链名，后面的数字代表残基位置编号（编号类型是POS还是UID，在上述参数Index Type中定义，默认为POS），最后一个字母代表突变后的残基。如：KA100N表示A链中位置编号（POS）100的残基K，突变为N。

• 每一行可放置一组突变，用英文逗号分隔，该组突变将被应用于结构中，得到一个新的结构文件。
  每行对应一个新的结构文件。
• UID编号支持插入码输入，如KA100BT，表示A链中UID编号为100B的残基K，突变为T。

结果说明

输出结果包括：