Multiple Sequence Alignment
简介
Multiple Sequence Alignment 是多重序列比对模块，用于进化分析，绘制进化树，帮助对候选序列进行聚类、分析多样性等。
参数说明
方法：msa
Input File
蛋白序列文件，FASTA格式。
方法：antibody
Input File
蛋白序列文件，FASTA格式。
Numbering Scheme
抗体编号方法，支持imgt，kabat，chothia
Full Sequence Identity
输出抗体整体序列一致性文件名称，CSV格式
CDR Sequence Identity
输出抗体CDR序列一致性文件名称，CSV格式
Identity Heatmap
输出抗体序列一致性热图，HTML格式
结果说明
输出结果包括：
| 输出文件名称 |
说明 |
| alignment.fasta |
多重序列进行比对后的FASTA文件 |
| alignment.png |
多重序列进行比对后的PNG文件 |
| newick.txt |
多重序列进行多样性分析的结果文件 |
| tree.png |
多重序列进化树图片 |
| out/full_identity.csv |
针对抗体方法下，抗体整体序列一致性CSV文件 |
| out/cdr_identity.csv |
针对抗体方法下，抗体CDR序列一致性CSV文件 |
| out/identity_heatmap.html |
针对抗体方法下，抗体序列一致性热图HTML文件 |
