Structural Alignment

简介

Structural Alignment是对两个蛋白质的三维结构进行叠合的工具。使用BLOSUM62矩阵和Needleman-Wunsch算法在两个序列之间执行全局配对比对，返回叠合后的蛋白结构，同时输出RMSD值。

参数说明

Reference Structure

参考蛋白的结构文件，PDB格式

Sample Structure

需要叠合蛋白的结构文件，PDB格式

Reference Chain

指定参考蛋白的链名，默认是A链

Sample Chain

指定需要叠合蛋白的链名，默认是A链

Output File

指定输出叠合后的结构文件，PDB格式

结果说明

输出结果包括：

其中result.csv包含如下信息：