Structure Mutagenesis

简介

对复合物界面区域进行单点或者多点的虚拟饱和突变，从而获得不同格式的突变文件以及突变后的Fasta文件。这为后续复合物之间的亲和力以及对突变体之间的结合自由能计算提供基础。

参数说明

Input File

蛋白结构文件，PDB格式。

Mutation Site

突变位点文件，JSON格式，一般由Complex Interface Analysis模块生成的json文件。

Chain Name

指定链名。

Output Sequence

指定输出突变后的序列文件的名称。

Mutated Policy

指定输出突变文件的名称，不包含链信息。

Chain Mutated Policy

指定输出突变文件的名称，包含指定链信息。

Mode

突变模式：

• Saturation：饱和突变，突变为其他19种氨基酸。
• AlaScan：丙氨酸突变，仅突变为丙氨酸。

结果说明

输出结果包括：