Protein BLAST

简介

Protein BLAST是蛋白Blast数据库，该数据库序列整合了GenPept、Swissprot、PIR、PDF、PDB、RefSeq等序列数据库。

参数说明

Input File

蛋白序列文件，FASTA格式。

Type

指定序列比对数据库类型：蛋白，抗体，或者CDR区域。
nr：蛋白Blast数据库。
oas：Observed Antibody Space，抗体Blast数据库。
cdr：CDR区域数据库，专利保护抗体数据库 。

结果说明

输出结果文件为alignment.fasta，是系列对齐后的FASTA文件，可在WeSeq中查看。