使用
编号100
名称

Homology Modeling (Protein)

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描述
蛋白质三维结构的同源性或比较建模。用户提供一个待建模的序列与已知相关结构的比对。通过满足空间约束条件进行比较蛋白质结构建模,以及许多其他任务,包括蛋白质结构中循环的全新建模、针对灵活定义的目标函数优化各种蛋白质结构模型、蛋白质序列和/或结构的多重比对、聚类、搜索序列数据库、比较蛋白质结构等。
标签
  • Biologics
  • Modeller
  • Homology
  • Comparative Modeling
作者B. Webb*; M.A. Marti-Renom*; A. Sali*; A. Fiser, R.K. Do*.
发布时间2021-12-21 17:39:18
参考文献
(1) B. Webb, A. Sali. Comparative Protein Structure Modeling Using Modeller. Current Protocols in Bioinformatics 54, John Wiley & Sons, Inc., 5.6.1-5.6.37, 2016. M.A. Marti-Renom, A. Stuart, A. Fiser, R. Sánchez, F. Melo, A. Sali. Comparative protein structure modeling of genes and genomes. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 29, 291-325, 2000. (2) A. Sali & T.L. Blundell. Comparative protein modelling by satisfaction of spatial restraints. J. Mol. Biol. 234, 779-815, 1993. (3) A. Fiser, R.K. Do, & A. Sali. Modeling of loops in protein structures, Protein Science 9. 1753-1773, 2000.